新疆大学的前身是创办于1924年的新疆俄文法政专门学校，1928年8月，改称为新疆省立俄文法政学校，1930年9月改为新疆俄文法政学院，1935年1月改建为新疆学院，1941年省建设厅农业学校并入新疆学院。1938年－1941年间，林基路、杜重远、茅盾、祁天民、张仲实、萨空了、史枚、高滔、江豪、涂冶、赵丹、郭春则等一批教育家、艺术家和进步人士，先后来学校担任领导、任教和讲学，学校名副其实地成为新疆传播革命真理的阵地和培养各族进步青年的摇篮。

解放后，1950年新疆语文学校和伊犁阿合买提江专科学校并入新疆学院，1950年10月1日更名为新疆民族学院，1951年6月新疆第二师范并入新疆民族学院，1953年11月西北民族学院畜牧系兽医班并入新疆民族学院，1954年复名为新疆学院，1960年10月1日正式成立新疆大学，1962年新疆大学与新疆师范学院合并，1962年7月新疆大学机械、电机、工电等3个工科专业划入新疆矿冶学院。 　　1978年新疆大学被国务院确定为新疆唯一的全国重点大学，1979年4月新疆大学由教师培训部、三平分校划出成立新疆师范大学，1997年列入国家“211工程”重点建设高校，2000年被确定为国家西部大开发重点建设大学。 　　新疆工学院前身是1953年1月成立的中苏有色金属公司矿山技术学校，1955年1月更名为重工业部乌鲁木齐矿业学校，1956年9月易名为冶金工业部乌鲁木齐矿业学校，1958年7月改名为新疆矿冶学院，1962年7月新疆大学机械、电机、工电等3个工科专业并入新疆矿冶学院，1966年5月更名为新疆工学院。 　　2000年12月30日，新疆大学与新疆工学院合并组建新的新疆大学。2004年，被国家教育部正式纳入与新疆自治区人民政府“省部共建”高校。 　　党和国家领导人十分关心新疆大学的建设和发展。周恩来总理对办好新疆学院曾作过重要指示，朱德、董必武等领导曾亲临学校视察工作，王震同志在任新疆分局书记期间曾多次率领驻疆人民解放军为学校修建校舍，中央教育部杨秀峰部长亲自来疆为学校选定校址并拨巨款建校，新疆和自治区的主要领导包尔汗、赛福鼎同志曾先后任新疆学院院长和新疆大学校长。 　　1995年，江泽民、李鹏、李岚清等领导分别为新疆大学亲笔题词。1994年和2000年，李岚清同志先后两次视察学校，强调新疆要集中力量办好新疆大学。 全国政协副主席阿不来提·阿不都热西提同志曾担任新疆大学名誉校长，现任自治区主席司马义·铁力瓦尔地同志亲自担任新疆大学名誉校长。 　　新疆大学现有本科专业涵盖文、理、工、法、经、管、史、哲、艺术等学科门类。现有18个学院、2个直属系、8个研究所、3个教学研究部、3个教学实践中心。

　　学校现有64个硕士点、3个专业学位硕士点，5个博士点、3个博士后流动站，2个国家重点学科、7个自治区重点学科，6个“211工程”重点建设学科，2个国家省部共建重点实验室培育基地，1个国家级人文社会科学基地，现有藏书175万册。学校已形成专科、本科、硕士、博士等多层次较为完整的高等教育体系。

新疆大学现有各类学生43000多人，其中普通本专科学生23000多人，研究生1100多人，其它学生19000多人。 　　新疆大学属自治区高水平科研基地，“十五”以来，学校获准的国家自然科学基金项目数和经费数，分别占全自治区科研单位和大专院校获准项目数的40%、经费数的50%；学校获得的纵横向科研项目和经费数均占自治区的50%。 　　新疆大学分校本部、北校区、南校区三个校区，共占地2464亩，建筑面积近80万平方米。拥有在新疆第一流的数字化图书馆、第一流的教学科研设施、第一流的学习和学术环境。

　《新疆大学总体发展战略规划》确定了学校“三步走”的发展目标：①到2010年前后，把新疆大学建成整体办学实力居于全国同类高校先进水平，在中亚地区有重要影响的综合性大学；②到2024年，建成全国同类高校一流大学，若干学科处于国内先进水平；③到本世纪中叶，建成国内先进、国际知名、开放式教学研究型大学，若干学科在国内领先，在国际上有重要影响，争取跻身中国名校行列。